Um den Datenschutz zu gewährleisten, werden bei der Produktion der Datensätze, bei der Archivierung und bei der Übermittlung nach aussen verschiedene technische Massnahmen ergriffen.
Sobald ein Datensatz die für die Qualitätssicherung notwendigen Kontrollphasen durchlaufen hat, werden die direkten Identifikatoren (wie beispielsweise der Name) gelöscht. Nur diejenigen Informationen werden beibehalten, die für die statistische Bearbeitung wichtig sind.
Bei der Weitergabe an Dritte werden weitere Massnahmen ergriffen, die verhindern sollen, dass Personen durch Verknüpfung von Informationen identifiziert werden können. Die wichtigsten Techniken bestehen darin, nur eine Auswahl der Daten weiterzugeben und den Detaillierungsgrad der Variablen zu reduzieren. Sollte dies nicht genügen oder die Qualität der statistischen Information zu stark beeinträchtigen, wird man gewisse Daten verbergen oder – mittels spezieller Techniken – sogar verfälschen.
Im europäischen Projekt "Central Network of Excellence for Statistical Disclosure Control", CENEX SDC (2007) (siehe Link unten), findet man eine Aufstellung der Datenschutzpraktiken in Europa sowie eine Software, mit welcher die Daten so verändert werden können, dass ein guter Schutz gewährleistet und gleichzeitig der Verlust statistischer Informationen minimal ist. Diese Software wurde im BFS beispielsweise für die Erstellung sog. Public Use Samples eingesetzt (siehe unter "Restriktiver Zugang zu anonymisierten Einzeldaten").